Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G7

Trbv1, T cell receptor beta, variable 1 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv1A0A0B4J1G7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Trbv1A0A0B4J1G7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trbv1A0A0B4J1G7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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