Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ms4a4bQ9ES61 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ms4a4bQ9ES61 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms