Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Atg4dQ8BGV9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg4dQ8BGV9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.3 ms