Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Psen1P49769 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psen1P49769 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psen1P49769 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psen1P49769 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psen1P49769 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psen1P49769 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psen1P49769 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psen1P49769 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psen1P49769 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psen1P49769 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psen1P49769 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psen1P49769 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Psen1P49769 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psen1P49769 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psen1P49769 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psen1P49769 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psen1P49769 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psen1P49769 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psen1P49769 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psen1P49769 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psen1P49769 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psen1P49769 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psen1P49769 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psen1P49769 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psen1P49769 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Psen1P49769 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Psen1P49769 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Psen1P49769 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Psen1P49769 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psen1P49769 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psen1P49769 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psen1P49769 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psen1P49769 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psen1P49769 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Psen1P49769 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms