Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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