Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Six6Q9QZ28 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Six6Q9QZ28 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.2 ms