Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Lsm4Q9QXA5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lsm4Q9QXA5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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