Protein–RNA interactions for Protein: P03980

Ig heavy chain V region TEPC 1017, mousemouse

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Length 138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P03980 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P03980 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P03980 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P03980 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P03980 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P03980 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P03980 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P03980 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P03980 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P03980 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P03980 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
P03980 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P03980 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P03980 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P03980 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P03980 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P03980 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P03980 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P03980 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P03980 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P03980 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P03980 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P03980 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P03980 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P03980 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P03980 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P03980 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P03980 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P03980 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P03980 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P03980 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P03980 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P03980 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P03980 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P03980 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P03980 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P03980 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P03980 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P03980 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P03980 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P03980 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P03980 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P03980 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P03980 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P03980 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P03980 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P03980 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P03980 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P03980 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P03980 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P03980 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P03980 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P03980 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P03980 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P03980 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P03980 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P03980 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P03980 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P03980 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P03980 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P03980 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P03980 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P03980 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P03980 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P03980 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P03980 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P03980 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P03980 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P03980 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P03980 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P03980 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P03980 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P03980 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P03980 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P03980 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P03980 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P03980 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P03980 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P03980 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P03980 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P03980 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P03980 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P03980 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P03980 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P03980 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P03980 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P03980 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P03980 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P03980 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P03980 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P03980 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P03980 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P03980 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P03980 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P03980 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P03980 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P03980 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P03980 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P03980 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P03980 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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