Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ddx20Q9JJY4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Ddx20Q9JJY4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx20Q9JJY4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms