Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Vstm5Q9D806 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Vstm5Q9D806 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms