Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PtprbB2RU80 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PtprbB2RU80 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.3 ms