Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hmgn5Q9JL35 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hmgn5Q9JL35 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms