Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gpa33Q9JKA5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gpa33Q9JKA5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms