Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
KRTAP9-8Q9BYQ0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms