Protein–RNA interactions for Protein: Q3U308

Ctu2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu2Q3U308 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctu2Q3U308 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms