Protein–RNA interactions for Protein: Q38HM4

Trim63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim63Q38HM4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trim63Q38HM4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim63Q38HM4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim63Q38HM4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim63Q38HM4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim63Q38HM4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim63Q38HM4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim63Q38HM4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim63Q38HM4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim63Q38HM4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim63Q38HM4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim63Q38HM4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim63Q38HM4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim63Q38HM4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim63Q38HM4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim63Q38HM4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim63Q38HM4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms