Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Sox12Q04890 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sox12Q04890 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Sox12Q04890 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sox12Q04890 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Sox12Q04890 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sox12Q04890 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sox12Q04890 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sox12Q04890 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sox12Q04890 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sox12Q04890 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sox12Q04890 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Sox12Q04890 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sox12Q04890 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sox12Q04890 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sox12Q04890 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sox12Q04890 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sox12Q04890 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sox12Q04890 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sox12Q04890 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sox12Q04890 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sox12Q04890 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sox12Q04890 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sox12Q04890 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Sox12Q04890 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Sox12Q04890 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Sox12Q04890 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sox12Q04890 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sox12Q04890 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sox12Q04890 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sox12Q04890 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sox12Q04890 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sox12Q04890 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sox12Q04890 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sox12Q04890 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sox12Q04890 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sox12Q04890 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Sox12Q04890 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sox12Q04890 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sox12Q04890 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sox12Q04890 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sox12Q04890 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sox12Q04890 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sox12Q04890 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Sox12Q04890 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sox12Q04890 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sox12Q04890 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sox12Q04890 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms