Protein–RNA interactions for Protein: O09106

Hdac1, Histone deacetylase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac1O09106 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hdac1O09106 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms