Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3550W4VSN7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gm3550W4VSN7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3550W4VSN7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3550W4VSN7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3550W4VSN7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3550W4VSN7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gm3550W4VSN7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3550W4VSN7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3550W4VSN7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gm3550W4VSN7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gm3550W4VSN7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3550W4VSN7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gm3550W4VSN7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3550W4VSN7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gm3550W4VSN7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3550W4VSN7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3550W4VSN7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3550W4VSN7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gm3550W4VSN7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gm3550W4VSN7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3550W4VSN7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gm3550W4VSN7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gm3550W4VSN7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3550W4VSN7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm3550W4VSN7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm3550W4VSN7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm3550W4VSN7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm3550W4VSN7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm3550W4VSN7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm3550W4VSN7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm3550W4VSN7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm3550W4VSN7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm3550W4VSN7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3550W4VSN7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3550W4VSN7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3550W4VSN7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3550W4VSN7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3550W4VSN7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3550W4VSN7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3550W4VSN7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3550W4VSN7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3550W4VSN7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3550W4VSN7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3550W4VSN7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3550W4VSN7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3550W4VSN7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3550W4VSN7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3550W4VSN7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3550W4VSN7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3550W4VSN7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3550W4VSN7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3550W4VSN7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3550W4VSN7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm3550W4VSN7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm3550W4VSN7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm3550W4VSN7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm3550W4VSN7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm3550W4VSN7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm3550W4VSN7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm3550W4VSN7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm3550W4VSN7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm3550W4VSN7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm3550W4VSN7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm3550W4VSN7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Gm3550W4VSN7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gm3550W4VSN7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm3550W4VSN7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm3550W4VSN7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm3550W4VSN7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gm3550W4VSN7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm3550W4VSN7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm3550W4VSN7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gm3550W4VSN7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm3550W4VSN7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm3550W4VSN7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm3550W4VSN7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gm3550W4VSN7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm3550W4VSN7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm3550W4VSN7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm3550W4VSN7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm3550W4VSN7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gm3550W4VSN7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm3550W4VSN7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gm3550W4VSN7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm3550W4VSN7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gm3550W4VSN7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3550W4VSN7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3550W4VSN7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gm3550W4VSN7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gm3550W4VSN7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm3550W4VSN7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gm3550W4VSN7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3550W4VSN7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gm3550W4VSN7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm3550W4VSN7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gm3550W4VSN7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm3550W4VSN7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm3550W4VSN7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm3550W4VSN7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms