Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z306

Slc22a4, Solute carrier family 22 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a4Q9Z306 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc22a4Q9Z306 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Slc22a4Q9Z306 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Slc22a4Q9Z306 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc22a4Q9Z306 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc22a4Q9Z306 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Slc22a4Q9Z306 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc22a4Q9Z306 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc22a4Q9Z306 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc22a4Q9Z306 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc22a4Q9Z306 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc22a4Q9Z306 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc22a4Q9Z306 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc22a4Q9Z306 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc22a4Q9Z306 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc22a4Q9Z306 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc22a4Q9Z306 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc22a4Q9Z306 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc22a4Q9Z306 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc22a4Q9Z306 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc22a4Q9Z306 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc22a4Q9Z306 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc22a4Q9Z306 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc22a4Q9Z306 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc22a4Q9Z306 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc22a4Q9Z306 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc22a4Q9Z306 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc22a4Q9Z306 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc22a4Q9Z306 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc22a4Q9Z306 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc22a4Q9Z306 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc22a4Q9Z306 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc22a4Q9Z306 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc22a4Q9Z306 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc22a4Q9Z306 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc22a4Q9Z306 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc22a4Q9Z306 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc22a4Q9Z306 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc22a4Q9Z306 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc22a4Q9Z306 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc22a4Q9Z306 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc22a4Q9Z306 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc22a4Q9Z306 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc22a4Q9Z306 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc22a4Q9Z306 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc22a4Q9Z306 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc22a4Q9Z306 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc22a4Q9Z306 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc22a4Q9Z306 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc22a4Q9Z306 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc22a4Q9Z306 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc22a4Q9Z306 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc22a4Q9Z306 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc22a4Q9Z306 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc22a4Q9Z306 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc22a4Q9Z306 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc22a4Q9Z306 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc22a4Q9Z306 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc22a4Q9Z306 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc22a4Q9Z306 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc22a4Q9Z306 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc22a4Q9Z306 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc22a4Q9Z306 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc22a4Q9Z306 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc22a4Q9Z306 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc22a4Q9Z306 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc22a4Q9Z306 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc22a4Q9Z306 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc22a4Q9Z306 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc22a4Q9Z306 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc22a4Q9Z306 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc22a4Q9Z306 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc22a4Q9Z306 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc22a4Q9Z306 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc22a4Q9Z306 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc22a4Q9Z306 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc22a4Q9Z306 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc22a4Q9Z306 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc22a4Q9Z306 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc22a4Q9Z306 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc22a4Q9Z306 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc22a4Q9Z306 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc22a4Q9Z306 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc22a4Q9Z306 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slc22a4Q9Z306 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slc22a4Q9Z306 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slc22a4Q9Z306 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc22a4Q9Z306 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc22a4Q9Z306 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc22a4Q9Z306 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc22a4Q9Z306 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc22a4Q9Z306 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc22a4Q9Z306 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc22a4Q9Z306 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc22a4Q9Z306 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc22a4Q9Z306 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc22a4Q9Z306 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc22a4Q9Z306 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc22a4Q9Z306 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc22a4Q9Z306 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms