Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cldn6Q9Z262 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cldn6Q9Z262 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cldn6Q9Z262 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cldn6Q9Z262 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cldn6Q9Z262 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cldn6Q9Z262 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cldn6Q9Z262 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cldn6Q9Z262 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cldn6Q9Z262 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cldn6Q9Z262 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cldn6Q9Z262 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cldn6Q9Z262 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cldn6Q9Z262 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cldn6Q9Z262 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cldn6Q9Z262 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cldn6Q9Z262 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cldn6Q9Z262 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cldn6Q9Z262 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cldn6Q9Z262 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cldn6Q9Z262 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cldn6Q9Z262 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cldn6Q9Z262 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Cldn6Q9Z262 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cldn6Q9Z262 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cldn6Q9Z262 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Cldn6Q9Z262 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cldn6Q9Z262 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cldn6Q9Z262 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cldn6Q9Z262 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cldn6Q9Z262 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cldn6Q9Z262 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cldn6Q9Z262 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cldn6Q9Z262 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cldn6Q9Z262 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cldn6Q9Z262 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cldn6Q9Z262 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cldn6Q9Z262 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cldn6Q9Z262 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cldn6Q9Z262 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cldn6Q9Z262 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cldn6Q9Z262 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cldn6Q9Z262 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cldn6Q9Z262 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cldn6Q9Z262 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cldn6Q9Z262 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cldn6Q9Z262 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cldn6Q9Z262 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cldn6Q9Z262 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cldn6Q9Z262 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cldn6Q9Z262 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cldn6Q9Z262 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cldn6Q9Z262 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cldn6Q9Z262 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cldn6Q9Z262 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cldn6Q9Z262 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cldn6Q9Z262 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cldn6Q9Z262 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cldn6Q9Z262 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cldn6Q9Z262 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cldn6Q9Z262 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cldn6Q9Z262 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cldn6Q9Z262 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cldn6Q9Z262 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cldn6Q9Z262 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cldn6Q9Z262 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cldn6Q9Z262 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cldn6Q9Z262 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cldn6Q9Z262 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cldn6Q9Z262 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cldn6Q9Z262 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cldn6Q9Z262 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cldn6Q9Z262 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cldn6Q9Z262 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cldn6Q9Z262 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cldn6Q9Z262 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cldn6Q9Z262 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cldn6Q9Z262 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cldn6Q9Z262 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cldn6Q9Z262 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cldn6Q9Z262 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cldn6Q9Z262 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cldn6Q9Z262 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cldn6Q9Z262 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cldn6Q9Z262 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cldn6Q9Z262 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cldn6Q9Z262 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cldn6Q9Z262 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cldn6Q9Z262 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cldn6Q9Z262 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cldn6Q9Z262 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cldn6Q9Z262 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cldn6Q9Z262 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cldn6Q9Z262 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cldn6Q9Z262 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cldn6Q9Z262 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cldn6Q9Z262 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cldn6Q9Z262 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cldn6Q9Z262 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cldn6Q9Z262 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms