Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0R4

Itsn1, Intersectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itsn1Q9Z0R4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Itsn1Q9Z0R4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Itsn1Q9Z0R4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Itsn1Q9Z0R4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Itsn1Q9Z0R4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Itsn1Q9Z0R4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
Itsn1Q9Z0R4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Itsn1Q9Z0R4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Itsn1Q9Z0R4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Itsn1Q9Z0R4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
Itsn1Q9Z0R4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Itsn1Q9Z0R4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Itsn1Q9Z0R4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Itsn1Q9Z0R4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
Itsn1Q9Z0R4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
Itsn1Q9Z0R4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Itsn1Q9Z0R4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Itsn1Q9Z0R4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Itsn1Q9Z0R4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Itsn1Q9Z0R4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Itsn1Q9Z0R4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Itsn1Q9Z0R4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Itsn1Q9Z0R4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
Itsn1Q9Z0R4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
Itsn1Q9Z0R4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Itsn1Q9Z0R4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Itsn1Q9Z0R4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Itsn1Q9Z0R4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Itsn1Q9Z0R4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Itsn1Q9Z0R4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Itsn1Q9Z0R4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Itsn1Q9Z0R4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
Itsn1Q9Z0R4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Itsn1Q9Z0R4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Itsn1Q9Z0R4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Itsn1Q9Z0R4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Itsn1Q9Z0R4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Itsn1Q9Z0R4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Itsn1Q9Z0R4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Itsn1Q9Z0R4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Itsn1Q9Z0R4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
Itsn1Q9Z0R4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Itsn1Q9Z0R4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
Itsn1Q9Z0R4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Itsn1Q9Z0R4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Itsn1Q9Z0R4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Itsn1Q9Z0R4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Itsn1Q9Z0R4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Itsn1Q9Z0R4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Itsn1Q9Z0R4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Itsn1Q9Z0R4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Itsn1Q9Z0R4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Itsn1Q9Z0R4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Itsn1Q9Z0R4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Itsn1Q9Z0R4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Itsn1Q9Z0R4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Itsn1Q9Z0R4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Itsn1Q9Z0R4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Itsn1Q9Z0R4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Itsn1Q9Z0R4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Itsn1Q9Z0R4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Itsn1Q9Z0R4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Itsn1Q9Z0R4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Itsn1Q9Z0R4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Itsn1Q9Z0R4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Itsn1Q9Z0R4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Itsn1Q9Z0R4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Itsn1Q9Z0R4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Itsn1Q9Z0R4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Itsn1Q9Z0R4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
Itsn1Q9Z0R4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Itsn1Q9Z0R4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Itsn1Q9Z0R4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Itsn1Q9Z0R4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Itsn1Q9Z0R4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Itsn1Q9Z0R4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Itsn1Q9Z0R4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Itsn1Q9Z0R4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Itsn1Q9Z0R4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Itsn1Q9Z0R4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
Itsn1Q9Z0R4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Itsn1Q9Z0R4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Itsn1Q9Z0R4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Itsn1Q9Z0R4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Itsn1Q9Z0R4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Itsn1Q9Z0R4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Itsn1Q9Z0R4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Itsn1Q9Z0R4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Itsn1Q9Z0R4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Itsn1Q9Z0R4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
Itsn1Q9Z0R4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Itsn1Q9Z0R4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Itsn1Q9Z0R4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Itsn1Q9Z0R4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Itsn1Q9Z0R4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Itsn1Q9Z0R4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Itsn1Q9Z0R4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Itsn1Q9Z0R4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Itsn1Q9Z0R4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Itsn1Q9Z0R4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms