Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0M3

Cdh20, Cadherin-20, mousemouse

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh20Q9Z0M3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdh20Q9Z0M3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdh20Q9Z0M3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdh20Q9Z0M3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdh20Q9Z0M3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdh20Q9Z0M3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdh20Q9Z0M3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdh20Q9Z0M3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdh20Q9Z0M3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdh20Q9Z0M3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdh20Q9Z0M3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdh20Q9Z0M3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh20Q9Z0M3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdh20Q9Z0M3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh20Q9Z0M3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh20Q9Z0M3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh20Q9Z0M3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdh20Q9Z0M3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdh20Q9Z0M3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdh20Q9Z0M3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdh20Q9Z0M3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdh20Q9Z0M3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cdh20Q9Z0M3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh20Q9Z0M3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh20Q9Z0M3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdh20Q9Z0M3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdh20Q9Z0M3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdh20Q9Z0M3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdh20Q9Z0M3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdh20Q9Z0M3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdh20Q9Z0M3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdh20Q9Z0M3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdh20Q9Z0M3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdh20Q9Z0M3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdh20Q9Z0M3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdh20Q9Z0M3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdh20Q9Z0M3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdh20Q9Z0M3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdh20Q9Z0M3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdh20Q9Z0M3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cdh20Q9Z0M3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cdh20Q9Z0M3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdh20Q9Z0M3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdh20Q9Z0M3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdh20Q9Z0M3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdh20Q9Z0M3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdh20Q9Z0M3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdh20Q9Z0M3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdh20Q9Z0M3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdh20Q9Z0M3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdh20Q9Z0M3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdh20Q9Z0M3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh20Q9Z0M3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh20Q9Z0M3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh20Q9Z0M3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh20Q9Z0M3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh20Q9Z0M3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh20Q9Z0M3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh20Q9Z0M3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh20Q9Z0M3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdh20Q9Z0M3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdh20Q9Z0M3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdh20Q9Z0M3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdh20Q9Z0M3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdh20Q9Z0M3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdh20Q9Z0M3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdh20Q9Z0M3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdh20Q9Z0M3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdh20Q9Z0M3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdh20Q9Z0M3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdh20Q9Z0M3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdh20Q9Z0M3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdh20Q9Z0M3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdh20Q9Z0M3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdh20Q9Z0M3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdh20Q9Z0M3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdh20Q9Z0M3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdh20Q9Z0M3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdh20Q9Z0M3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdh20Q9Z0M3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdh20Q9Z0M3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdh20Q9Z0M3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdh20Q9Z0M3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdh20Q9Z0M3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cdh20Q9Z0M3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh20Q9Z0M3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh20Q9Z0M3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdh20Q9Z0M3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdh20Q9Z0M3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdh20Q9Z0M3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdh20Q9Z0M3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdh20Q9Z0M3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdh20Q9Z0M3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdh20Q9Z0M3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdh20Q9Z0M3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh20Q9Z0M3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh20Q9Z0M3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh20Q9Z0M3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdh20Q9Z0M3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdh20Q9Z0M3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms