Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVB4

Slit3, Slit homolog 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit3Q9WVB4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Slit3Q9WVB4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Slit3Q9WVB4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Slit3Q9WVB4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Slit3Q9WVB4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Slit3Q9WVB4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Slit3Q9WVB4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Slit3Q9WVB4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Slit3Q9WVB4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Slit3Q9WVB4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Slit3Q9WVB4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Slit3Q9WVB4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Slit3Q9WVB4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Slit3Q9WVB4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
Slit3Q9WVB4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Slit3Q9WVB4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Slit3Q9WVB4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Slit3Q9WVB4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Slit3Q9WVB4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Slit3Q9WVB4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Slit3Q9WVB4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Slit3Q9WVB4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Slit3Q9WVB4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
Slit3Q9WVB4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Slit3Q9WVB4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Slit3Q9WVB4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Slit3Q9WVB4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Slit3Q9WVB4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Slit3Q9WVB4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Slit3Q9WVB4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Slit3Q9WVB4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Slit3Q9WVB4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Slit3Q9WVB4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Slit3Q9WVB4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Slit3Q9WVB4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Slit3Q9WVB4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Slit3Q9WVB4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Slit3Q9WVB4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Slit3Q9WVB4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Slit3Q9WVB4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Slit3Q9WVB4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Slit3Q9WVB4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Slit3Q9WVB4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Slit3Q9WVB4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Slit3Q9WVB4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
Slit3Q9WVB4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Slit3Q9WVB4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Slit3Q9WVB4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Slit3Q9WVB4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Slit3Q9WVB4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Slit3Q9WVB4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Slit3Q9WVB4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Slit3Q9WVB4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Slit3Q9WVB4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
Slit3Q9WVB4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Slit3Q9WVB4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Slit3Q9WVB4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Slit3Q9WVB4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Slit3Q9WVB4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Slit3Q9WVB4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Slit3Q9WVB4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Slit3Q9WVB4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Slit3Q9WVB4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC35.82■■■■□ 3.33
Slit3Q9WVB4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Slit3Q9WVB4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Slit3Q9WVB4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Slit3Q9WVB4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Slit3Q9WVB4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Slit3Q9WVB4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Slit3Q9WVB4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Slit3Q9WVB4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Slit3Q9WVB4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Slit3Q9WVB4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Slit3Q9WVB4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Slit3Q9WVB4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Slit3Q9WVB4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Slit3Q9WVB4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Slit3Q9WVB4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
Slit3Q9WVB4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Slit3Q9WVB4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Slit3Q9WVB4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Slit3Q9WVB4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Slit3Q9WVB4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Slit3Q9WVB4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Slit3Q9WVB4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Slit3Q9WVB4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Slit3Q9WVB4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Slit3Q9WVB4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Slit3Q9WVB4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Slit3Q9WVB4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
Slit3Q9WVB4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Slit3Q9WVB4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Slit3Q9WVB4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Slit3Q9WVB4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Slit3Q9WVB4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Slit3Q9WVB4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
Slit3Q9WVB4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Slit3Q9WVB4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Slit3Q9WVB4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Slit3Q9WVB4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms