Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1W3

Rnf103, E3 ubiquitin-protein ligase RNF103, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf103Q9R1W3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rnf103Q9R1W3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rnf103Q9R1W3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rnf103Q9R1W3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rnf103Q9R1W3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rnf103Q9R1W3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rnf103Q9R1W3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rnf103Q9R1W3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rnf103Q9R1W3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rnf103Q9R1W3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rnf103Q9R1W3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rnf103Q9R1W3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rnf103Q9R1W3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rnf103Q9R1W3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rnf103Q9R1W3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rnf103Q9R1W3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rnf103Q9R1W3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rnf103Q9R1W3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rnf103Q9R1W3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Rnf103Q9R1W3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rnf103Q9R1W3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Rnf103Q9R1W3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rnf103Q9R1W3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rnf103Q9R1W3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rnf103Q9R1W3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rnf103Q9R1W3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rnf103Q9R1W3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Rnf103Q9R1W3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rnf103Q9R1W3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rnf103Q9R1W3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rnf103Q9R1W3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rnf103Q9R1W3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rnf103Q9R1W3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rnf103Q9R1W3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rnf103Q9R1W3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rnf103Q9R1W3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Rnf103Q9R1W3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rnf103Q9R1W3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Rnf103Q9R1W3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rnf103Q9R1W3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rnf103Q9R1W3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rnf103Q9R1W3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rnf103Q9R1W3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rnf103Q9R1W3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rnf103Q9R1W3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rnf103Q9R1W3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rnf103Q9R1W3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rnf103Q9R1W3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rnf103Q9R1W3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rnf103Q9R1W3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rnf103Q9R1W3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rnf103Q9R1W3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rnf103Q9R1W3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Rnf103Q9R1W3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rnf103Q9R1W3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rnf103Q9R1W3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rnf103Q9R1W3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rnf103Q9R1W3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rnf103Q9R1W3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rnf103Q9R1W3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rnf103Q9R1W3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Rnf103Q9R1W3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rnf103Q9R1W3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rnf103Q9R1W3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rnf103Q9R1W3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Rnf103Q9R1W3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rnf103Q9R1W3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rnf103Q9R1W3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rnf103Q9R1W3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rnf103Q9R1W3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rnf103Q9R1W3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rnf103Q9R1W3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rnf103Q9R1W3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rnf103Q9R1W3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rnf103Q9R1W3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rnf103Q9R1W3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rnf103Q9R1W3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rnf103Q9R1W3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rnf103Q9R1W3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rnf103Q9R1W3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rnf103Q9R1W3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rnf103Q9R1W3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rnf103Q9R1W3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rnf103Q9R1W3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rnf103Q9R1W3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rnf103Q9R1W3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rnf103Q9R1W3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rnf103Q9R1W3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rnf103Q9R1W3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rnf103Q9R1W3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rnf103Q9R1W3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rnf103Q9R1W3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Rnf103Q9R1W3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rnf103Q9R1W3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rnf103Q9R1W3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rnf103Q9R1W3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rnf103Q9R1W3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rnf103Q9R1W3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rnf103Q9R1W3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rnf103Q9R1W3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms