Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clcf1Q9QZM3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Clcf1Q9QZM3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Clcf1Q9QZM3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clcf1Q9QZM3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Clcf1Q9QZM3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clcf1Q9QZM3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clcf1Q9QZM3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clcf1Q9QZM3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clcf1Q9QZM3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clcf1Q9QZM3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clcf1Q9QZM3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clcf1Q9QZM3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clcf1Q9QZM3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clcf1Q9QZM3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Clcf1Q9QZM3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Clcf1Q9QZM3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Clcf1Q9QZM3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clcf1Q9QZM3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clcf1Q9QZM3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clcf1Q9QZM3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clcf1Q9QZM3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clcf1Q9QZM3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clcf1Q9QZM3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clcf1Q9QZM3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clcf1Q9QZM3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clcf1Q9QZM3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clcf1Q9QZM3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clcf1Q9QZM3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clcf1Q9QZM3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clcf1Q9QZM3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clcf1Q9QZM3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clcf1Q9QZM3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clcf1Q9QZM3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clcf1Q9QZM3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Clcf1Q9QZM3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clcf1Q9QZM3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clcf1Q9QZM3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clcf1Q9QZM3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clcf1Q9QZM3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clcf1Q9QZM3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clcf1Q9QZM3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clcf1Q9QZM3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clcf1Q9QZM3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clcf1Q9QZM3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clcf1Q9QZM3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clcf1Q9QZM3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clcf1Q9QZM3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Clcf1Q9QZM3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clcf1Q9QZM3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clcf1Q9QZM3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clcf1Q9QZM3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clcf1Q9QZM3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clcf1Q9QZM3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clcf1Q9QZM3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clcf1Q9QZM3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clcf1Q9QZM3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clcf1Q9QZM3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clcf1Q9QZM3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clcf1Q9QZM3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clcf1Q9QZM3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clcf1Q9QZM3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clcf1Q9QZM3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clcf1Q9QZM3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clcf1Q9QZM3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clcf1Q9QZM3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Clcf1Q9QZM3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Clcf1Q9QZM3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clcf1Q9QZM3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clcf1Q9QZM3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clcf1Q9QZM3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clcf1Q9QZM3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clcf1Q9QZM3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clcf1Q9QZM3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clcf1Q9QZM3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clcf1Q9QZM3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Clcf1Q9QZM3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clcf1Q9QZM3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clcf1Q9QZM3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clcf1Q9QZM3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Clcf1Q9QZM3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clcf1Q9QZM3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clcf1Q9QZM3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clcf1Q9QZM3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clcf1Q9QZM3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clcf1Q9QZM3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Clcf1Q9QZM3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clcf1Q9QZM3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clcf1Q9QZM3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clcf1Q9QZM3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clcf1Q9QZM3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Clcf1Q9QZM3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clcf1Q9QZM3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clcf1Q9QZM3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clcf1Q9QZM3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clcf1Q9QZM3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clcf1Q9QZM3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clcf1Q9QZM3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clcf1Q9QZM3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clcf1Q9QZM3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms