Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Copg1Q9QZE5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Copg1Q9QZE5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Copg1Q9QZE5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Copg1Q9QZE5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Copg1Q9QZE5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Copg1Q9QZE5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Copg1Q9QZE5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Copg1Q9QZE5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Copg1Q9QZE5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Copg1Q9QZE5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Copg1Q9QZE5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Copg1Q9QZE5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Copg1Q9QZE5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Copg1Q9QZE5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Copg1Q9QZE5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Copg1Q9QZE5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Copg1Q9QZE5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Copg1Q9QZE5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Copg1Q9QZE5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Copg1Q9QZE5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Copg1Q9QZE5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Copg1Q9QZE5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Copg1Q9QZE5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Copg1Q9QZE5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Copg1Q9QZE5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Copg1Q9QZE5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Copg1Q9QZE5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Copg1Q9QZE5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Copg1Q9QZE5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Copg1Q9QZE5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Copg1Q9QZE5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Copg1Q9QZE5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Copg1Q9QZE5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Copg1Q9QZE5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Copg1Q9QZE5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Copg1Q9QZE5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Copg1Q9QZE5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Copg1Q9QZE5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Copg1Q9QZE5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Copg1Q9QZE5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Copg1Q9QZE5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Copg1Q9QZE5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Copg1Q9QZE5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Copg1Q9QZE5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Copg1Q9QZE5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Copg1Q9QZE5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Copg1Q9QZE5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Copg1Q9QZE5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Copg1Q9QZE5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Copg1Q9QZE5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Copg1Q9QZE5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Copg1Q9QZE5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Copg1Q9QZE5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Copg1Q9QZE5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Copg1Q9QZE5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Copg1Q9QZE5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Copg1Q9QZE5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Copg1Q9QZE5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Copg1Q9QZE5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Copg1Q9QZE5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Copg1Q9QZE5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Copg1Q9QZE5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Copg1Q9QZE5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Copg1Q9QZE5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Copg1Q9QZE5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Copg1Q9QZE5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Copg1Q9QZE5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Copg1Q9QZE5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Copg1Q9QZE5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Copg1Q9QZE5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Copg1Q9QZE5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Copg1Q9QZE5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Copg1Q9QZE5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Copg1Q9QZE5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Copg1Q9QZE5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Copg1Q9QZE5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Copg1Q9QZE5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Copg1Q9QZE5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Copg1Q9QZE5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Copg1Q9QZE5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Copg1Q9QZE5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Copg1Q9QZE5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Copg1Q9QZE5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Copg1Q9QZE5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Copg1Q9QZE5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Copg1Q9QZE5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Copg1Q9QZE5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Copg1Q9QZE5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Copg1Q9QZE5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Copg1Q9QZE5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Copg1Q9QZE5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Copg1Q9QZE5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Copg1Q9QZE5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Copg1Q9QZE5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Copg1Q9QZE5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Copg1Q9QZE5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Copg1Q9QZE5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Copg1Q9QZE5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Copg1Q9QZE5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms