Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK7

Rnf11, RING finger protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf11Q9QYK7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnf11Q9QYK7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnf11Q9QYK7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rnf11Q9QYK7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rnf11Q9QYK7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rnf11Q9QYK7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rnf11Q9QYK7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rnf11Q9QYK7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rnf11Q9QYK7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rnf11Q9QYK7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnf11Q9QYK7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnf11Q9QYK7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rnf11Q9QYK7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf11Q9QYK7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rnf11Q9QYK7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnf11Q9QYK7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rnf11Q9QYK7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rnf11Q9QYK7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rnf11Q9QYK7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rnf11Q9QYK7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rnf11Q9QYK7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rnf11Q9QYK7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf11Q9QYK7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf11Q9QYK7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf11Q9QYK7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf11Q9QYK7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf11Q9QYK7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf11Q9QYK7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf11Q9QYK7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf11Q9QYK7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf11Q9QYK7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf11Q9QYK7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf11Q9QYK7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf11Q9QYK7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf11Q9QYK7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf11Q9QYK7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf11Q9QYK7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf11Q9QYK7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf11Q9QYK7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf11Q9QYK7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf11Q9QYK7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf11Q9QYK7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf11Q9QYK7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf11Q9QYK7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rnf11Q9QYK7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf11Q9QYK7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf11Q9QYK7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf11Q9QYK7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf11Q9QYK7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf11Q9QYK7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf11Q9QYK7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf11Q9QYK7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf11Q9QYK7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf11Q9QYK7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf11Q9QYK7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf11Q9QYK7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf11Q9QYK7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf11Q9QYK7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf11Q9QYK7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf11Q9QYK7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf11Q9QYK7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf11Q9QYK7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf11Q9QYK7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf11Q9QYK7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf11Q9QYK7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf11Q9QYK7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf11Q9QYK7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf11Q9QYK7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf11Q9QYK7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf11Q9QYK7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf11Q9QYK7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf11Q9QYK7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf11Q9QYK7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf11Q9QYK7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf11Q9QYK7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf11Q9QYK7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf11Q9QYK7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf11Q9QYK7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf11Q9QYK7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf11Q9QYK7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf11Q9QYK7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf11Q9QYK7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf11Q9QYK7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf11Q9QYK7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf11Q9QYK7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf11Q9QYK7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf11Q9QYK7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf11Q9QYK7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf11Q9QYK7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf11Q9QYK7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf11Q9QYK7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rnf11Q9QYK7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf11Q9QYK7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf11Q9QYK7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf11Q9QYK7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf11Q9QYK7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rnf11Q9QYK7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf11Q9QYK7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rnf11Q9QYK7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rnf11Q9QYK7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms