Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ndrg3Q9QYF9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ndrg3Q9QYF9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ndrg3Q9QYF9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ndrg3Q9QYF9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ndrg3Q9QYF9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ndrg3Q9QYF9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ndrg3Q9QYF9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ndrg3Q9QYF9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ndrg3Q9QYF9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ndrg3Q9QYF9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ndrg3Q9QYF9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ndrg3Q9QYF9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndrg3Q9QYF9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndrg3Q9QYF9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndrg3Q9QYF9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndrg3Q9QYF9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndrg3Q9QYF9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndrg3Q9QYF9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndrg3Q9QYF9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndrg3Q9QYF9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ndrg3Q9QYF9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndrg3Q9QYF9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndrg3Q9QYF9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndrg3Q9QYF9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndrg3Q9QYF9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndrg3Q9QYF9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndrg3Q9QYF9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndrg3Q9QYF9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndrg3Q9QYF9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndrg3Q9QYF9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndrg3Q9QYF9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndrg3Q9QYF9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ndrg3Q9QYF9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ndrg3Q9QYF9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ndrg3Q9QYF9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ndrg3Q9QYF9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ndrg3Q9QYF9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ndrg3Q9QYF9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ndrg3Q9QYF9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ndrg3Q9QYF9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndrg3Q9QYF9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndrg3Q9QYF9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndrg3Q9QYF9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndrg3Q9QYF9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ndrg3Q9QYF9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ndrg3Q9QYF9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ndrg3Q9QYF9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ndrg3Q9QYF9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ndrg3Q9QYF9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ndrg3Q9QYF9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ndrg3Q9QYF9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ndrg3Q9QYF9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ndrg3Q9QYF9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ndrg3Q9QYF9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ndrg3Q9QYF9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ndrg3Q9QYF9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ndrg3Q9QYF9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ndrg3Q9QYF9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ndrg3Q9QYF9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ndrg3Q9QYF9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ndrg3Q9QYF9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ndrg3Q9QYF9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ndrg3Q9QYF9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndrg3Q9QYF9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndrg3Q9QYF9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndrg3Q9QYF9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ndrg3Q9QYF9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ndrg3Q9QYF9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ndrg3Q9QYF9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndrg3Q9QYF9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndrg3Q9QYF9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndrg3Q9QYF9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndrg3Q9QYF9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndrg3Q9QYF9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndrg3Q9QYF9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndrg3Q9QYF9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndrg3Q9QYF9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ndrg3Q9QYF9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ndrg3Q9QYF9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndrg3Q9QYF9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndrg3Q9QYF9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndrg3Q9QYF9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndrg3Q9QYF9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndrg3Q9QYF9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndrg3Q9QYF9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndrg3Q9QYF9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndrg3Q9QYF9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndrg3Q9QYF9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndrg3Q9QYF9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndrg3Q9QYF9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ndrg3Q9QYF9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ndrg3Q9QYF9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndrg3Q9QYF9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndrg3Q9QYF9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndrg3Q9QYF9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndrg3Q9QYF9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndrg3Q9QYF9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ndrg3Q9QYF9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ndrg3Q9QYF9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms