Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY40

Plxnb3, Plexin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 1,902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnb3Q9QY40 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Plxnb3Q9QY40 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Plxnb3Q9QY40 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Plxnb3Q9QY40 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Plxnb3Q9QY40 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Plxnb3Q9QY40 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Plxnb3Q9QY40 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Plxnb3Q9QY40 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Plxnb3Q9QY40 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Plxnb3Q9QY40 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Plxnb3Q9QY40 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Plxnb3Q9QY40 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Plxnb3Q9QY40 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Plxnb3Q9QY40 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Plxnb3Q9QY40 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Plxnb3Q9QY40 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Plxnb3Q9QY40 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Plxnb3Q9QY40 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Plxnb3Q9QY40 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Plxnb3Q9QY40 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Plxnb3Q9QY40 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Plxnb3Q9QY40 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Plxnb3Q9QY40 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Plxnb3Q9QY40 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Plxnb3Q9QY40 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Plxnb3Q9QY40 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Plxnb3Q9QY40 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Plxnb3Q9QY40 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Plxnb3Q9QY40 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Plxnb3Q9QY40 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Plxnb3Q9QY40 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Plxnb3Q9QY40 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Plxnb3Q9QY40 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Plxnb3Q9QY40 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Plxnb3Q9QY40 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Plxnb3Q9QY40 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Plxnb3Q9QY40 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Plxnb3Q9QY40 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Plxnb3Q9QY40 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Plxnb3Q9QY40 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Plxnb3Q9QY40 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Plxnb3Q9QY40 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Plxnb3Q9QY40 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Plxnb3Q9QY40 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Plxnb3Q9QY40 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Plxnb3Q9QY40 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Plxnb3Q9QY40 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Plxnb3Q9QY40 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Plxnb3Q9QY40 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Plxnb3Q9QY40 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Plxnb3Q9QY40 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Plxnb3Q9QY40 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Plxnb3Q9QY40 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Plxnb3Q9QY40 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Plxnb3Q9QY40 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Plxnb3Q9QY40 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Plxnb3Q9QY40 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Plxnb3Q9QY40 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Plxnb3Q9QY40 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Plxnb3Q9QY40 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Plxnb3Q9QY40 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Plxnb3Q9QY40 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Plxnb3Q9QY40 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Plxnb3Q9QY40 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Plxnb3Q9QY40 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Plxnb3Q9QY40 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Plxnb3Q9QY40 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Plxnb3Q9QY40 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Plxnb3Q9QY40 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Plxnb3Q9QY40 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Plxnb3Q9QY40 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Plxnb3Q9QY40 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Plxnb3Q9QY40 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Plxnb3Q9QY40 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Plxnb3Q9QY40 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Plxnb3Q9QY40 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Plxnb3Q9QY40 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Plxnb3Q9QY40 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Plxnb3Q9QY40 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Plxnb3Q9QY40 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Plxnb3Q9QY40 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Plxnb3Q9QY40 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Plxnb3Q9QY40 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Plxnb3Q9QY40 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Plxnb3Q9QY40 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Plxnb3Q9QY40 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Plxnb3Q9QY40 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Plxnb3Q9QY40 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Plxnb3Q9QY40 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Plxnb3Q9QY40 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Plxnb3Q9QY40 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Plxnb3Q9QY40 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Plxnb3Q9QY40 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Plxnb3Q9QY40 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Plxnb3Q9QY40 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Plxnb3Q9QY40 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Plxnb3Q9QY40 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Plxnb3Q9QY40 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Plxnb3Q9QY40 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Plxnb3Q9QY40 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms