Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pcsk1nQ9QXV0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pcsk1nQ9QXV0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pcsk1nQ9QXV0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pcsk1nQ9QXV0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pcsk1nQ9QXV0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pcsk1nQ9QXV0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Pcsk1nQ9QXV0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Pcsk1nQ9QXV0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pcsk1nQ9QXV0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pcsk1nQ9QXV0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pcsk1nQ9QXV0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pcsk1nQ9QXV0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pcsk1nQ9QXV0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pcsk1nQ9QXV0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pcsk1nQ9QXV0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pcsk1nQ9QXV0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pcsk1nQ9QXV0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pcsk1nQ9QXV0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pcsk1nQ9QXV0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pcsk1nQ9QXV0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pcsk1nQ9QXV0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pcsk1nQ9QXV0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pcsk1nQ9QXV0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcsk1nQ9QXV0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcsk1nQ9QXV0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcsk1nQ9QXV0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pcsk1nQ9QXV0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pcsk1nQ9QXV0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pcsk1nQ9QXV0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pcsk1nQ9QXV0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Pcsk1nQ9QXV0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pcsk1nQ9QXV0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pcsk1nQ9QXV0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Pcsk1nQ9QXV0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pcsk1nQ9QXV0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pcsk1nQ9QXV0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pcsk1nQ9QXV0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pcsk1nQ9QXV0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pcsk1nQ9QXV0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pcsk1nQ9QXV0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Pcsk1nQ9QXV0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pcsk1nQ9QXV0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pcsk1nQ9QXV0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pcsk1nQ9QXV0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pcsk1nQ9QXV0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pcsk1nQ9QXV0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pcsk1nQ9QXV0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pcsk1nQ9QXV0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pcsk1nQ9QXV0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Pcsk1nQ9QXV0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pcsk1nQ9QXV0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Pcsk1nQ9QXV0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pcsk1nQ9QXV0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pcsk1nQ9QXV0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pcsk1nQ9QXV0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pcsk1nQ9QXV0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcsk1nQ9QXV0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcsk1nQ9QXV0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcsk1nQ9QXV0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcsk1nQ9QXV0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pcsk1nQ9QXV0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pcsk1nQ9QXV0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Pcsk1nQ9QXV0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pcsk1nQ9QXV0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pcsk1nQ9QXV0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pcsk1nQ9QXV0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pcsk1nQ9QXV0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pcsk1nQ9QXV0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pcsk1nQ9QXV0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pcsk1nQ9QXV0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Pcsk1nQ9QXV0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pcsk1nQ9QXV0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pcsk1nQ9QXV0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcsk1nQ9QXV0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pcsk1nQ9QXV0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcsk1nQ9QXV0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcsk1nQ9QXV0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcsk1nQ9QXV0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcsk1nQ9QXV0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pcsk1nQ9QXV0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pcsk1nQ9QXV0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pcsk1nQ9QXV0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pcsk1nQ9QXV0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pcsk1nQ9QXV0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pcsk1nQ9QXV0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pcsk1nQ9QXV0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcsk1nQ9QXV0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcsk1nQ9QXV0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcsk1nQ9QXV0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcsk1nQ9QXV0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcsk1nQ9QXV0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcsk1nQ9QXV0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcsk1nQ9QXV0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms