Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pcsk1nQ9QXV0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pcsk1nQ9QXV0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pcsk1nQ9QXV0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pcsk1nQ9QXV0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pcsk1nQ9QXV0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pcsk1nQ9QXV0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Pcsk1nQ9QXV0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Pcsk1nQ9QXV0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pcsk1nQ9QXV0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pcsk1nQ9QXV0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pcsk1nQ9QXV0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pcsk1nQ9QXV0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pcsk1nQ9QXV0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pcsk1nQ9QXV0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pcsk1nQ9QXV0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pcsk1nQ9QXV0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pcsk1nQ9QXV0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pcsk1nQ9QXV0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pcsk1nQ9QXV0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pcsk1nQ9QXV0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pcsk1nQ9QXV0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pcsk1nQ9QXV0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pcsk1nQ9QXV0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcsk1nQ9QXV0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcsk1nQ9QXV0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcsk1nQ9QXV0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcsk1nQ9QXV0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pcsk1nQ9QXV0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pcsk1nQ9QXV0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pcsk1nQ9QXV0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pcsk1nQ9QXV0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Pcsk1nQ9QXV0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pcsk1nQ9QXV0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pcsk1nQ9QXV0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Pcsk1nQ9QXV0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pcsk1nQ9QXV0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pcsk1nQ9QXV0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pcsk1nQ9QXV0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pcsk1nQ9QXV0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pcsk1nQ9QXV0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pcsk1nQ9QXV0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Pcsk1nQ9QXV0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pcsk1nQ9QXV0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pcsk1nQ9QXV0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pcsk1nQ9QXV0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pcsk1nQ9QXV0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pcsk1nQ9QXV0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Pcsk1nQ9QXV0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pcsk1nQ9QXV0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pcsk1nQ9QXV0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Pcsk1nQ9QXV0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Pcsk1nQ9QXV0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Pcsk1nQ9QXV0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pcsk1nQ9QXV0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pcsk1nQ9QXV0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pcsk1nQ9QXV0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pcsk1nQ9QXV0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcsk1nQ9QXV0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcsk1nQ9QXV0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcsk1nQ9QXV0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Pcsk1nQ9QXV0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pcsk1nQ9QXV0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pcsk1nQ9QXV0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Pcsk1nQ9QXV0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pcsk1nQ9QXV0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pcsk1nQ9QXV0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pcsk1nQ9QXV0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pcsk1nQ9QXV0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pcsk1nQ9QXV0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pcsk1nQ9QXV0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pcsk1nQ9QXV0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Pcsk1nQ9QXV0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pcsk1nQ9QXV0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pcsk1nQ9QXV0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pcsk1nQ9QXV0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pcsk1nQ9QXV0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcsk1nQ9QXV0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pcsk1nQ9QXV0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcsk1nQ9QXV0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pcsk1nQ9QXV0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pcsk1nQ9QXV0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pcsk1nQ9QXV0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pcsk1nQ9QXV0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pcsk1nQ9QXV0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pcsk1nQ9QXV0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pcsk1nQ9QXV0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pcsk1nQ9QXV0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pcsk1nQ9QXV0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcsk1nQ9QXV0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcsk1nQ9QXV0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pcsk1nQ9QXV0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcsk1nQ9QXV0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcsk1nQ9QXV0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pcsk1nQ9QXV0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms