Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cul3Q9JLV5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cul3Q9JLV5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cul3Q9JLV5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cul3Q9JLV5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cul3Q9JLV5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cul3Q9JLV5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cul3Q9JLV5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cul3Q9JLV5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cul3Q9JLV5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cul3Q9JLV5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cul3Q9JLV5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cul3Q9JLV5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cul3Q9JLV5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cul3Q9JLV5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cul3Q9JLV5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cul3Q9JLV5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cul3Q9JLV5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cul3Q9JLV5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cul3Q9JLV5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cul3Q9JLV5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cul3Q9JLV5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Cul3Q9JLV5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cul3Q9JLV5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cul3Q9JLV5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cul3Q9JLV5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cul3Q9JLV5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cul3Q9JLV5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cul3Q9JLV5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cul3Q9JLV5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cul3Q9JLV5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cul3Q9JLV5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cul3Q9JLV5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cul3Q9JLV5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cul3Q9JLV5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cul3Q9JLV5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cul3Q9JLV5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cul3Q9JLV5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cul3Q9JLV5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cul3Q9JLV5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cul3Q9JLV5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cul3Q9JLV5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cul3Q9JLV5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cul3Q9JLV5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cul3Q9JLV5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cul3Q9JLV5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cul3Q9JLV5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cul3Q9JLV5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cul3Q9JLV5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cul3Q9JLV5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cul3Q9JLV5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cul3Q9JLV5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cul3Q9JLV5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cul3Q9JLV5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cul3Q9JLV5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cul3Q9JLV5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cul3Q9JLV5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cul3Q9JLV5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cul3Q9JLV5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cul3Q9JLV5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cul3Q9JLV5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cul3Q9JLV5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cul3Q9JLV5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cul3Q9JLV5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cul3Q9JLV5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cul3Q9JLV5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cul3Q9JLV5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cul3Q9JLV5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cul3Q9JLV5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cul3Q9JLV5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cul3Q9JLV5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Cul3Q9JLV5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cul3Q9JLV5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cul3Q9JLV5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cul3Q9JLV5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cul3Q9JLV5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cul3Q9JLV5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cul3Q9JLV5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cul3Q9JLV5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cul3Q9JLV5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cul3Q9JLV5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cul3Q9JLV5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cul3Q9JLV5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cul3Q9JLV5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cul3Q9JLV5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Cul3Q9JLV5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cul3Q9JLV5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cul3Q9JLV5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cul3Q9JLV5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cul3Q9JLV5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cul3Q9JLV5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cul3Q9JLV5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cul3Q9JLV5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cul3Q9JLV5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cul3Q9JLV5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cul3Q9JLV5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cul3Q9JLV5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cul3Q9JLV5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cul3Q9JLV5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cul3Q9JLV5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms