Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL18

Bace2, Beta-secretase 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace2Q9JL18 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Bace2Q9JL18 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Bace2Q9JL18 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Bace2Q9JL18 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Bace2Q9JL18 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Bace2Q9JL18 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Bace2Q9JL18 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Bace2Q9JL18 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Bace2Q9JL18 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Bace2Q9JL18 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Bace2Q9JL18 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Bace2Q9JL18 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Bace2Q9JL18 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Bace2Q9JL18 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Bace2Q9JL18 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Bace2Q9JL18 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Bace2Q9JL18 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Bace2Q9JL18 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Bace2Q9JL18 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Bace2Q9JL18 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Bace2Q9JL18 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Bace2Q9JL18 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Bace2Q9JL18 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Bace2Q9JL18 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Bace2Q9JL18 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Bace2Q9JL18 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Bace2Q9JL18 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Bace2Q9JL18 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Bace2Q9JL18 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Bace2Q9JL18 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Bace2Q9JL18 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Bace2Q9JL18 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Bace2Q9JL18 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Bace2Q9JL18 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Bace2Q9JL18 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Bace2Q9JL18 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Bace2Q9JL18 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Bace2Q9JL18 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Bace2Q9JL18 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Bace2Q9JL18 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Bace2Q9JL18 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Bace2Q9JL18 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Bace2Q9JL18 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Bace2Q9JL18 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Bace2Q9JL18 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Bace2Q9JL18 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Bace2Q9JL18 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Bace2Q9JL18 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Bace2Q9JL18 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Bace2Q9JL18 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Bace2Q9JL18 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Bace2Q9JL18 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Bace2Q9JL18 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Bace2Q9JL18 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Bace2Q9JL18 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Bace2Q9JL18 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Bace2Q9JL18 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Bace2Q9JL18 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Bace2Q9JL18 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Bace2Q9JL18 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Bace2Q9JL18 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Bace2Q9JL18 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Bace2Q9JL18 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Bace2Q9JL18 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Bace2Q9JL18 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Bace2Q9JL18 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Bace2Q9JL18 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Bace2Q9JL18 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Bace2Q9JL18 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Bace2Q9JL18 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Bace2Q9JL18 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Bace2Q9JL18 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Bace2Q9JL18 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Bace2Q9JL18 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Bace2Q9JL18 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Bace2Q9JL18 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Bace2Q9JL18 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Bace2Q9JL18 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Bace2Q9JL18 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Bace2Q9JL18 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Bace2Q9JL18 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Bace2Q9JL18 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Bace2Q9JL18 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Bace2Q9JL18 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Bace2Q9JL18 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Bace2Q9JL18 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Bace2Q9JL18 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Bace2Q9JL18 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Bace2Q9JL18 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Bace2Q9JL18 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Bace2Q9JL18 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Bace2Q9JL18 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Bace2Q9JL18 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bace2Q9JL18 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Bace2Q9JL18 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Bace2Q9JL18 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Bace2Q9JL18 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bace2Q9JL18 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bace2Q9JL18 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bace2Q9JL18 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms