Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHU2

Palmd, Palmdelphin, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PalmdQ9JHU2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PalmdQ9JHU2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PalmdQ9JHU2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PalmdQ9JHU2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PalmdQ9JHU2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PalmdQ9JHU2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PalmdQ9JHU2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PalmdQ9JHU2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PalmdQ9JHU2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PalmdQ9JHU2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PalmdQ9JHU2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PalmdQ9JHU2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PalmdQ9JHU2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PalmdQ9JHU2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PalmdQ9JHU2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PalmdQ9JHU2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PalmdQ9JHU2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PalmdQ9JHU2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PalmdQ9JHU2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PalmdQ9JHU2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PalmdQ9JHU2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PalmdQ9JHU2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PalmdQ9JHU2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PalmdQ9JHU2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PalmdQ9JHU2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PalmdQ9JHU2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PalmdQ9JHU2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PalmdQ9JHU2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PalmdQ9JHU2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PalmdQ9JHU2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PalmdQ9JHU2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PalmdQ9JHU2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PalmdQ9JHU2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PalmdQ9JHU2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PalmdQ9JHU2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PalmdQ9JHU2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PalmdQ9JHU2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PalmdQ9JHU2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PalmdQ9JHU2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PalmdQ9JHU2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PalmdQ9JHU2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PalmdQ9JHU2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PalmdQ9JHU2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PalmdQ9JHU2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PalmdQ9JHU2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PalmdQ9JHU2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PalmdQ9JHU2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PalmdQ9JHU2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PalmdQ9JHU2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PalmdQ9JHU2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PalmdQ9JHU2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PalmdQ9JHU2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PalmdQ9JHU2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PalmdQ9JHU2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PalmdQ9JHU2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PalmdQ9JHU2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PalmdQ9JHU2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PalmdQ9JHU2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PalmdQ9JHU2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PalmdQ9JHU2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PalmdQ9JHU2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PalmdQ9JHU2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PalmdQ9JHU2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PalmdQ9JHU2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PalmdQ9JHU2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PalmdQ9JHU2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PalmdQ9JHU2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PalmdQ9JHU2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PalmdQ9JHU2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PalmdQ9JHU2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PalmdQ9JHU2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PalmdQ9JHU2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PalmdQ9JHU2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PalmdQ9JHU2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PalmdQ9JHU2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PalmdQ9JHU2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PalmdQ9JHU2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PalmdQ9JHU2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PalmdQ9JHU2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PalmdQ9JHU2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PalmdQ9JHU2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PalmdQ9JHU2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PalmdQ9JHU2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PalmdQ9JHU2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PalmdQ9JHU2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PalmdQ9JHU2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PalmdQ9JHU2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PalmdQ9JHU2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PalmdQ9JHU2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PalmdQ9JHU2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PalmdQ9JHU2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PalmdQ9JHU2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PalmdQ9JHU2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PalmdQ9JHU2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PalmdQ9JHU2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PalmdQ9JHU2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PalmdQ9JHU2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PalmdQ9JHU2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PalmdQ9JHU2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PalmdQ9JHU2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms