Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS4

Clpx, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpxQ9JHS4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ClpxQ9JHS4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ClpxQ9JHS4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ClpxQ9JHS4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ClpxQ9JHS4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ClpxQ9JHS4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ClpxQ9JHS4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ClpxQ9JHS4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ClpxQ9JHS4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ClpxQ9JHS4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ClpxQ9JHS4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClpxQ9JHS4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ClpxQ9JHS4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ClpxQ9JHS4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ClpxQ9JHS4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ClpxQ9JHS4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ClpxQ9JHS4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ClpxQ9JHS4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ClpxQ9JHS4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ClpxQ9JHS4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ClpxQ9JHS4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ClpxQ9JHS4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ClpxQ9JHS4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ClpxQ9JHS4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ClpxQ9JHS4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ClpxQ9JHS4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ClpxQ9JHS4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ClpxQ9JHS4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ClpxQ9JHS4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ClpxQ9JHS4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ClpxQ9JHS4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ClpxQ9JHS4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ClpxQ9JHS4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ClpxQ9JHS4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ClpxQ9JHS4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ClpxQ9JHS4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ClpxQ9JHS4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ClpxQ9JHS4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ClpxQ9JHS4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ClpxQ9JHS4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ClpxQ9JHS4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ClpxQ9JHS4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ClpxQ9JHS4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ClpxQ9JHS4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ClpxQ9JHS4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ClpxQ9JHS4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ClpxQ9JHS4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ClpxQ9JHS4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ClpxQ9JHS4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ClpxQ9JHS4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ClpxQ9JHS4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ClpxQ9JHS4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ClpxQ9JHS4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ClpxQ9JHS4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ClpxQ9JHS4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ClpxQ9JHS4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ClpxQ9JHS4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ClpxQ9JHS4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ClpxQ9JHS4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ClpxQ9JHS4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ClpxQ9JHS4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ClpxQ9JHS4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ClpxQ9JHS4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ClpxQ9JHS4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ClpxQ9JHS4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ClpxQ9JHS4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ClpxQ9JHS4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ClpxQ9JHS4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ClpxQ9JHS4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ClpxQ9JHS4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ClpxQ9JHS4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ClpxQ9JHS4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ClpxQ9JHS4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ClpxQ9JHS4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ClpxQ9JHS4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ClpxQ9JHS4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ClpxQ9JHS4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ClpxQ9JHS4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ClpxQ9JHS4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ClpxQ9JHS4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ClpxQ9JHS4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ClpxQ9JHS4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ClpxQ9JHS4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ClpxQ9JHS4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ClpxQ9JHS4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ClpxQ9JHS4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ClpxQ9JHS4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ClpxQ9JHS4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ClpxQ9JHS4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ClpxQ9JHS4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ClpxQ9JHS4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ClpxQ9JHS4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ClpxQ9JHS4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ClpxQ9JHS4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ClpxQ9JHS4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ClpxQ9JHS4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ClpxQ9JHS4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ClpxQ9JHS4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ClpxQ9JHS4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ClpxQ9JHS4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms