Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DysfQ9ESD7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DysfQ9ESD7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DysfQ9ESD7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DysfQ9ESD7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DysfQ9ESD7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DysfQ9ESD7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DysfQ9ESD7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DysfQ9ESD7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DysfQ9ESD7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DysfQ9ESD7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DysfQ9ESD7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DysfQ9ESD7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DysfQ9ESD7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DysfQ9ESD7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DysfQ9ESD7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DysfQ9ESD7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
DysfQ9ESD7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DysfQ9ESD7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DysfQ9ESD7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DysfQ9ESD7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DysfQ9ESD7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DysfQ9ESD7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DysfQ9ESD7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DysfQ9ESD7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DysfQ9ESD7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
DysfQ9ESD7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DysfQ9ESD7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
DysfQ9ESD7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
DysfQ9ESD7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DysfQ9ESD7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
DysfQ9ESD7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DysfQ9ESD7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DysfQ9ESD7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DysfQ9ESD7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DysfQ9ESD7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DysfQ9ESD7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DysfQ9ESD7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DysfQ9ESD7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DysfQ9ESD7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DysfQ9ESD7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DysfQ9ESD7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DysfQ9ESD7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DysfQ9ESD7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DysfQ9ESD7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DysfQ9ESD7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DysfQ9ESD7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DysfQ9ESD7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DysfQ9ESD7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DysfQ9ESD7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DysfQ9ESD7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DysfQ9ESD7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DysfQ9ESD7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DysfQ9ESD7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DysfQ9ESD7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DysfQ9ESD7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DysfQ9ESD7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DysfQ9ESD7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DysfQ9ESD7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DysfQ9ESD7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DysfQ9ESD7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DysfQ9ESD7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DysfQ9ESD7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DysfQ9ESD7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DysfQ9ESD7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DysfQ9ESD7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DysfQ9ESD7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DysfQ9ESD7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DysfQ9ESD7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DysfQ9ESD7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DysfQ9ESD7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DysfQ9ESD7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DysfQ9ESD7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DysfQ9ESD7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DysfQ9ESD7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DysfQ9ESD7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DysfQ9ESD7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DysfQ9ESD7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DysfQ9ESD7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DysfQ9ESD7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DysfQ9ESD7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DysfQ9ESD7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DysfQ9ESD7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DysfQ9ESD7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DysfQ9ESD7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DysfQ9ESD7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DysfQ9ESD7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DysfQ9ESD7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DysfQ9ESD7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DysfQ9ESD7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DysfQ9ESD7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DysfQ9ESD7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DysfQ9ESD7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DysfQ9ESD7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DysfQ9ESD7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DysfQ9ESD7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DysfQ9ESD7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DysfQ9ESD7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DysfQ9ESD7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DysfQ9ESD7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms