Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERY9

Erg28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erg28Q9ERY9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Erg28Q9ERY9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Erg28Q9ERY9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Erg28Q9ERY9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Erg28Q9ERY9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Erg28Q9ERY9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Erg28Q9ERY9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Erg28Q9ERY9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Erg28Q9ERY9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Erg28Q9ERY9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Erg28Q9ERY9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Erg28Q9ERY9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Erg28Q9ERY9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Erg28Q9ERY9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Erg28Q9ERY9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Erg28Q9ERY9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Erg28Q9ERY9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Erg28Q9ERY9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Erg28Q9ERY9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Erg28Q9ERY9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Erg28Q9ERY9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Erg28Q9ERY9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Erg28Q9ERY9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Erg28Q9ERY9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Erg28Q9ERY9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Erg28Q9ERY9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Erg28Q9ERY9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Erg28Q9ERY9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Erg28Q9ERY9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Erg28Q9ERY9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Erg28Q9ERY9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Erg28Q9ERY9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Erg28Q9ERY9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Erg28Q9ERY9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Erg28Q9ERY9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Erg28Q9ERY9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Erg28Q9ERY9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Erg28Q9ERY9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Erg28Q9ERY9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Erg28Q9ERY9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Erg28Q9ERY9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Erg28Q9ERY9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Erg28Q9ERY9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Erg28Q9ERY9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Erg28Q9ERY9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Erg28Q9ERY9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Erg28Q9ERY9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Erg28Q9ERY9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Erg28Q9ERY9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Erg28Q9ERY9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Erg28Q9ERY9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Erg28Q9ERY9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Erg28Q9ERY9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Erg28Q9ERY9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Erg28Q9ERY9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Erg28Q9ERY9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Erg28Q9ERY9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Erg28Q9ERY9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Erg28Q9ERY9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Erg28Q9ERY9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Erg28Q9ERY9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Erg28Q9ERY9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Erg28Q9ERY9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Erg28Q9ERY9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Erg28Q9ERY9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Erg28Q9ERY9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Erg28Q9ERY9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Erg28Q9ERY9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Erg28Q9ERY9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Erg28Q9ERY9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Erg28Q9ERY9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Erg28Q9ERY9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Erg28Q9ERY9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Erg28Q9ERY9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Erg28Q9ERY9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Erg28Q9ERY9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Erg28Q9ERY9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Erg28Q9ERY9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Erg28Q9ERY9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Erg28Q9ERY9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Erg28Q9ERY9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Erg28Q9ERY9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Erg28Q9ERY9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Erg28Q9ERY9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Erg28Q9ERY9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Erg28Q9ERY9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Erg28Q9ERY9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Erg28Q9ERY9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Erg28Q9ERY9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Erg28Q9ERY9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Erg28Q9ERY9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Erg28Q9ERY9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Erg28Q9ERY9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Erg28Q9ERY9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Erg28Q9ERY9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Erg28Q9ERY9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Erg28Q9ERY9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Erg28Q9ERY9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Erg28Q9ERY9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Erg28Q9ERY9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms