Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPS4

Vmn1r172, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r172Q9EPS4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vmn1r172Q9EPS4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vmn1r172Q9EPS4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vmn1r172Q9EPS4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn1r172Q9EPS4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vmn1r172Q9EPS4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r172Q9EPS4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vmn1r172Q9EPS4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn1r172Q9EPS4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vmn1r172Q9EPS4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r172Q9EPS4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r172Q9EPS4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vmn1r172Q9EPS4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn1r172Q9EPS4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn1r172Q9EPS4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vmn1r172Q9EPS4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r172Q9EPS4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vmn1r172Q9EPS4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn1r172Q9EPS4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn1r172Q9EPS4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn1r172Q9EPS4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vmn1r172Q9EPS4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r172Q9EPS4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r172Q9EPS4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vmn1r172Q9EPS4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r172Q9EPS4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Vmn1r172Q9EPS4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r172Q9EPS4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r172Q9EPS4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r172Q9EPS4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vmn1r172Q9EPS4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vmn1r172Q9EPS4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn1r172Q9EPS4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vmn1r172Q9EPS4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r172Q9EPS4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r172Q9EPS4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r172Q9EPS4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vmn1r172Q9EPS4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r172Q9EPS4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r172Q9EPS4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r172Q9EPS4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Vmn1r172Q9EPS4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r172Q9EPS4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r172Q9EPS4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r172Q9EPS4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r172Q9EPS4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vmn1r172Q9EPS4 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vmn1r172Q9EPS4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vmn1r172Q9EPS4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Vmn1r172Q9EPS4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vmn1r172Q9EPS4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r172Q9EPS4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vmn1r172Q9EPS4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vmn1r172Q9EPS4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r172Q9EPS4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r172Q9EPS4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r172Q9EPS4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r172Q9EPS4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r172Q9EPS4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vmn1r172Q9EPS4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r172Q9EPS4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vmn1r172Q9EPS4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r172Q9EPS4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Vmn1r172Q9EPS4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vmn1r172Q9EPS4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmn1r172Q9EPS4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r172Q9EPS4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r172Q9EPS4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Vmn1r172Q9EPS4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vmn1r172Q9EPS4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn1r172Q9EPS4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vmn1r172Q9EPS4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r172Q9EPS4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r172Q9EPS4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r172Q9EPS4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vmn1r172Q9EPS4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r172Q9EPS4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vmn1r172Q9EPS4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r172Q9EPS4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vmn1r172Q9EPS4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r172Q9EPS4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vmn1r172Q9EPS4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r172Q9EPS4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vmn1r172Q9EPS4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r172Q9EPS4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vmn1r172Q9EPS4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r172Q9EPS4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r172Q9EPS4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r172Q9EPS4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r172Q9EPS4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vmn1r172Q9EPS4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r172Q9EPS4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r172Q9EPS4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vmn1r172Q9EPS4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vmn1r172Q9EPS4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vmn1r172Q9EPS4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Vmn1r172Q9EPS4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r172Q9EPS4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r172Q9EPS4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vmn1r172Q9EPS4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms