Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC53

Cpne8, Copine-8, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne8Q9DC53 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cpne8Q9DC53 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cpne8Q9DC53 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Cpne8Q9DC53 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cpne8Q9DC53 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cpne8Q9DC53 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cpne8Q9DC53 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cpne8Q9DC53 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cpne8Q9DC53 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Cpne8Q9DC53 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Cpne8Q9DC53 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cpne8Q9DC53 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cpne8Q9DC53 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cpne8Q9DC53 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cpne8Q9DC53 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cpne8Q9DC53 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cpne8Q9DC53 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cpne8Q9DC53 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cpne8Q9DC53 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cpne8Q9DC53 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cpne8Q9DC53 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cpne8Q9DC53 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Cpne8Q9DC53 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cpne8Q9DC53 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cpne8Q9DC53 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cpne8Q9DC53 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cpne8Q9DC53 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cpne8Q9DC53 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cpne8Q9DC53 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cpne8Q9DC53 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Cpne8Q9DC53 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cpne8Q9DC53 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cpne8Q9DC53 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cpne8Q9DC53 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cpne8Q9DC53 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cpne8Q9DC53 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cpne8Q9DC53 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Cpne8Q9DC53 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cpne8Q9DC53 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cpne8Q9DC53 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cpne8Q9DC53 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cpne8Q9DC53 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cpne8Q9DC53 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cpne8Q9DC53 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cpne8Q9DC53 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cpne8Q9DC53 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cpne8Q9DC53 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cpne8Q9DC53 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cpne8Q9DC53 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cpne8Q9DC53 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Cpne8Q9DC53 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cpne8Q9DC53 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cpne8Q9DC53 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cpne8Q9DC53 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cpne8Q9DC53 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cpne8Q9DC53 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cpne8Q9DC53 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cpne8Q9DC53 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cpne8Q9DC53 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cpne8Q9DC53 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cpne8Q9DC53 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cpne8Q9DC53 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cpne8Q9DC53 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cpne8Q9DC53 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cpne8Q9DC53 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cpne8Q9DC53 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cpne8Q9DC53 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cpne8Q9DC53 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cpne8Q9DC53 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cpne8Q9DC53 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cpne8Q9DC53 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cpne8Q9DC53 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cpne8Q9DC53 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cpne8Q9DC53 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cpne8Q9DC53 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cpne8Q9DC53 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cpne8Q9DC53 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cpne8Q9DC53 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cpne8Q9DC53 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cpne8Q9DC53 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Cpne8Q9DC53 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cpne8Q9DC53 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cpne8Q9DC53 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cpne8Q9DC53 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cpne8Q9DC53 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cpne8Q9DC53 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cpne8Q9DC53 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cpne8Q9DC53 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cpne8Q9DC53 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cpne8Q9DC53 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cpne8Q9DC53 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cpne8Q9DC53 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cpne8Q9DC53 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cpne8Q9DC53 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cpne8Q9DC53 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cpne8Q9DC53 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cpne8Q9DC53 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cpne8Q9DC53 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cpne8Q9DC53 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cpne8Q9DC53 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.2 ms