Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N5

Cib4, Calcium and integrin-binding family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib4Q9D9N5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cib4Q9D9N5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cib4Q9D9N5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cib4Q9D9N5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cib4Q9D9N5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cib4Q9D9N5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cib4Q9D9N5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cib4Q9D9N5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cib4Q9D9N5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cib4Q9D9N5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cib4Q9D9N5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cib4Q9D9N5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cib4Q9D9N5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cib4Q9D9N5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cib4Q9D9N5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cib4Q9D9N5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cib4Q9D9N5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cib4Q9D9N5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cib4Q9D9N5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cib4Q9D9N5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cib4Q9D9N5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cib4Q9D9N5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cib4Q9D9N5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cib4Q9D9N5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cib4Q9D9N5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cib4Q9D9N5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cib4Q9D9N5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cib4Q9D9N5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cib4Q9D9N5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cib4Q9D9N5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cib4Q9D9N5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cib4Q9D9N5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cib4Q9D9N5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cib4Q9D9N5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cib4Q9D9N5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cib4Q9D9N5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cib4Q9D9N5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cib4Q9D9N5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cib4Q9D9N5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cib4Q9D9N5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cib4Q9D9N5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cib4Q9D9N5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cib4Q9D9N5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Cib4Q9D9N5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cib4Q9D9N5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cib4Q9D9N5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cib4Q9D9N5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cib4Q9D9N5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cib4Q9D9N5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cib4Q9D9N5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cib4Q9D9N5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cib4Q9D9N5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cib4Q9D9N5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cib4Q9D9N5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cib4Q9D9N5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cib4Q9D9N5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cib4Q9D9N5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cib4Q9D9N5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cib4Q9D9N5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cib4Q9D9N5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cib4Q9D9N5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cib4Q9D9N5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cib4Q9D9N5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cib4Q9D9N5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cib4Q9D9N5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cib4Q9D9N5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cib4Q9D9N5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cib4Q9D9N5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cib4Q9D9N5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cib4Q9D9N5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cib4Q9D9N5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cib4Q9D9N5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cib4Q9D9N5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cib4Q9D9N5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cib4Q9D9N5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cib4Q9D9N5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cib4Q9D9N5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cib4Q9D9N5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cib4Q9D9N5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cib4Q9D9N5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cib4Q9D9N5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cib4Q9D9N5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cib4Q9D9N5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cib4Q9D9N5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cib4Q9D9N5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cib4Q9D9N5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cib4Q9D9N5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cib4Q9D9N5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cib4Q9D9N5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cib4Q9D9N5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cib4Q9D9N5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cib4Q9D9N5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cib4Q9D9N5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cib4Q9D9N5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cib4Q9D9N5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cib4Q9D9N5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cib4Q9D9N5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cib4Q9D9N5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cib4Q9D9N5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cib4Q9D9N5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.7 ms