Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W4

Tspan17, Tetraspanin-17, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan17Q9D7W4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Tspan17Q9D7W4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Tspan17Q9D7W4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tspan17Q9D7W4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tspan17Q9D7W4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tspan17Q9D7W4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tspan17Q9D7W4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tspan17Q9D7W4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tspan17Q9D7W4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tspan17Q9D7W4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tspan17Q9D7W4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tspan17Q9D7W4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tspan17Q9D7W4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Tspan17Q9D7W4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tspan17Q9D7W4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tspan17Q9D7W4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tspan17Q9D7W4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tspan17Q9D7W4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tspan17Q9D7W4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Tspan17Q9D7W4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tspan17Q9D7W4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tspan17Q9D7W4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tspan17Q9D7W4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tspan17Q9D7W4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tspan17Q9D7W4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tspan17Q9D7W4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tspan17Q9D7W4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tspan17Q9D7W4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tspan17Q9D7W4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tspan17Q9D7W4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Tspan17Q9D7W4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Tspan17Q9D7W4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tspan17Q9D7W4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tspan17Q9D7W4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tspan17Q9D7W4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tspan17Q9D7W4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Tspan17Q9D7W4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tspan17Q9D7W4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tspan17Q9D7W4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tspan17Q9D7W4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tspan17Q9D7W4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tspan17Q9D7W4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tspan17Q9D7W4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tspan17Q9D7W4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tspan17Q9D7W4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tspan17Q9D7W4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tspan17Q9D7W4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tspan17Q9D7W4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tspan17Q9D7W4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tspan17Q9D7W4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Tspan17Q9D7W4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tspan17Q9D7W4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Tspan17Q9D7W4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tspan17Q9D7W4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tspan17Q9D7W4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tspan17Q9D7W4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tspan17Q9D7W4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tspan17Q9D7W4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tspan17Q9D7W4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tspan17Q9D7W4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tspan17Q9D7W4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tspan17Q9D7W4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tspan17Q9D7W4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tspan17Q9D7W4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tspan17Q9D7W4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tspan17Q9D7W4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tspan17Q9D7W4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tspan17Q9D7W4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tspan17Q9D7W4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tspan17Q9D7W4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tspan17Q9D7W4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tspan17Q9D7W4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tspan17Q9D7W4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tspan17Q9D7W4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tspan17Q9D7W4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tspan17Q9D7W4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tspan17Q9D7W4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tspan17Q9D7W4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tspan17Q9D7W4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tspan17Q9D7W4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tspan17Q9D7W4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tspan17Q9D7W4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Tspan17Q9D7W4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tspan17Q9D7W4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tspan17Q9D7W4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tspan17Q9D7W4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tspan17Q9D7W4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tspan17Q9D7W4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tspan17Q9D7W4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tspan17Q9D7W4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tspan17Q9D7W4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tspan17Q9D7W4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tspan17Q9D7W4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tspan17Q9D7W4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tspan17Q9D7W4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tspan17Q9D7W4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tspan17Q9D7W4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tspan17Q9D7W4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tspan17Q9D7W4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tspan17Q9D7W4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.8 ms