Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Efhd1Q9D4J1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Efhd1Q9D4J1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Efhd1Q9D4J1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Efhd1Q9D4J1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Efhd1Q9D4J1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Efhd1Q9D4J1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Efhd1Q9D4J1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Efhd1Q9D4J1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Efhd1Q9D4J1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Efhd1Q9D4J1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Efhd1Q9D4J1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Efhd1Q9D4J1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Efhd1Q9D4J1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Efhd1Q9D4J1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Efhd1Q9D4J1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Efhd1Q9D4J1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Efhd1Q9D4J1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Efhd1Q9D4J1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Efhd1Q9D4J1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Efhd1Q9D4J1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Efhd1Q9D4J1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Efhd1Q9D4J1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Efhd1Q9D4J1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Efhd1Q9D4J1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Efhd1Q9D4J1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Efhd1Q9D4J1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Efhd1Q9D4J1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Efhd1Q9D4J1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Efhd1Q9D4J1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Efhd1Q9D4J1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Efhd1Q9D4J1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Efhd1Q9D4J1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Efhd1Q9D4J1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Efhd1Q9D4J1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Efhd1Q9D4J1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Efhd1Q9D4J1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Efhd1Q9D4J1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Efhd1Q9D4J1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Efhd1Q9D4J1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Efhd1Q9D4J1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Efhd1Q9D4J1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Efhd1Q9D4J1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Efhd1Q9D4J1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Efhd1Q9D4J1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Efhd1Q9D4J1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Efhd1Q9D4J1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Efhd1Q9D4J1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Efhd1Q9D4J1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Efhd1Q9D4J1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Efhd1Q9D4J1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Efhd1Q9D4J1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Efhd1Q9D4J1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Efhd1Q9D4J1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Efhd1Q9D4J1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Efhd1Q9D4J1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Efhd1Q9D4J1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Efhd1Q9D4J1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Efhd1Q9D4J1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Efhd1Q9D4J1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Efhd1Q9D4J1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Efhd1Q9D4J1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Efhd1Q9D4J1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Efhd1Q9D4J1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Efhd1Q9D4J1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Efhd1Q9D4J1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Efhd1Q9D4J1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Efhd1Q9D4J1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Efhd1Q9D4J1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Efhd1Q9D4J1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Efhd1Q9D4J1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Efhd1Q9D4J1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Efhd1Q9D4J1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Efhd1Q9D4J1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Efhd1Q9D4J1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Efhd1Q9D4J1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Efhd1Q9D4J1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Efhd1Q9D4J1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Efhd1Q9D4J1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Efhd1Q9D4J1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Efhd1Q9D4J1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Efhd1Q9D4J1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Efhd1Q9D4J1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Efhd1Q9D4J1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Efhd1Q9D4J1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Efhd1Q9D4J1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Efhd1Q9D4J1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Efhd1Q9D4J1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Efhd1Q9D4J1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Efhd1Q9D4J1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Efhd1Q9D4J1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Efhd1Q9D4J1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Efhd1Q9D4J1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Efhd1Q9D4J1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Efhd1Q9D4J1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Efhd1Q9D4J1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Efhd1Q9D4J1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Efhd1Q9D4J1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Efhd1Q9D4J1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Efhd1Q9D4J1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms