Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3T1

4933436I01Rik, RIKEN cDNA 4933436I01, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933436I01RikQ9D3T1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
4933436I01RikQ9D3T1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
4933436I01RikQ9D3T1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
4933436I01RikQ9D3T1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
4933436I01RikQ9D3T1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
4933436I01RikQ9D3T1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
4933436I01RikQ9D3T1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
4933436I01RikQ9D3T1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
4933436I01RikQ9D3T1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
4933436I01RikQ9D3T1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4933436I01RikQ9D3T1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4933436I01RikQ9D3T1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
4933436I01RikQ9D3T1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
4933436I01RikQ9D3T1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
4933436I01RikQ9D3T1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4933436I01RikQ9D3T1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
4933436I01RikQ9D3T1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
4933436I01RikQ9D3T1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4933436I01RikQ9D3T1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4933436I01RikQ9D3T1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
4933436I01RikQ9D3T1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
4933436I01RikQ9D3T1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
4933436I01RikQ9D3T1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
4933436I01RikQ9D3T1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4933436I01RikQ9D3T1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
4933436I01RikQ9D3T1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4933436I01RikQ9D3T1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4933436I01RikQ9D3T1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
4933436I01RikQ9D3T1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
4933436I01RikQ9D3T1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
4933436I01RikQ9D3T1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
4933436I01RikQ9D3T1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4933436I01RikQ9D3T1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4933436I01RikQ9D3T1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
4933436I01RikQ9D3T1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4933436I01RikQ9D3T1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933436I01RikQ9D3T1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
4933436I01RikQ9D3T1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933436I01RikQ9D3T1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933436I01RikQ9D3T1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
4933436I01RikQ9D3T1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
4933436I01RikQ9D3T1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4933436I01RikQ9D3T1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4933436I01RikQ9D3T1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
4933436I01RikQ9D3T1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
4933436I01RikQ9D3T1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4933436I01RikQ9D3T1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4933436I01RikQ9D3T1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4933436I01RikQ9D3T1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4933436I01RikQ9D3T1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4933436I01RikQ9D3T1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4933436I01RikQ9D3T1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4933436I01RikQ9D3T1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
4933436I01RikQ9D3T1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
4933436I01RikQ9D3T1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
4933436I01RikQ9D3T1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4933436I01RikQ9D3T1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4933436I01RikQ9D3T1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
4933436I01RikQ9D3T1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4933436I01RikQ9D3T1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4933436I01RikQ9D3T1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
4933436I01RikQ9D3T1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4933436I01RikQ9D3T1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4933436I01RikQ9D3T1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4933436I01RikQ9D3T1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4933436I01RikQ9D3T1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
4933436I01RikQ9D3T1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
4933436I01RikQ9D3T1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4933436I01RikQ9D3T1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
4933436I01RikQ9D3T1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
4933436I01RikQ9D3T1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4933436I01RikQ9D3T1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4933436I01RikQ9D3T1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
4933436I01RikQ9D3T1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
4933436I01RikQ9D3T1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
4933436I01RikQ9D3T1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4933436I01RikQ9D3T1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
4933436I01RikQ9D3T1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4933436I01RikQ9D3T1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
4933436I01RikQ9D3T1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
4933436I01RikQ9D3T1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4933436I01RikQ9D3T1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4933436I01RikQ9D3T1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4933436I01RikQ9D3T1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
4933436I01RikQ9D3T1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4933436I01RikQ9D3T1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933436I01RikQ9D3T1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933436I01RikQ9D3T1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4933436I01RikQ9D3T1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933436I01RikQ9D3T1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933436I01RikQ9D3T1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933436I01RikQ9D3T1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933436I01RikQ9D3T1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933436I01RikQ9D3T1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933436I01RikQ9D3T1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933436I01RikQ9D3T1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4933436I01RikQ9D3T1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
4933436I01RikQ9D3T1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4933436I01RikQ9D3T1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4933436I01RikQ9D3T1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms