Protein–RNA interactions for Protein: Q9D287

Bcas2, Pre-mRNA-splicing factor SPF27, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas2Q9D287 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Bcas2Q9D287 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bcas2Q9D287 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Bcas2Q9D287 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bcas2Q9D287 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bcas2Q9D287 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bcas2Q9D287 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bcas2Q9D287 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Bcas2Q9D287 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Bcas2Q9D287 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Bcas2Q9D287 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bcas2Q9D287 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bcas2Q9D287 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Bcas2Q9D287 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bcas2Q9D287 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bcas2Q9D287 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bcas2Q9D287 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Bcas2Q9D287 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bcas2Q9D287 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bcas2Q9D287 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Bcas2Q9D287 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Bcas2Q9D287 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Bcas2Q9D287 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Bcas2Q9D287 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Bcas2Q9D287 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Bcas2Q9D287 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Bcas2Q9D287 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Bcas2Q9D287 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Bcas2Q9D287 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bcas2Q9D287 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Bcas2Q9D287 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Bcas2Q9D287 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Bcas2Q9D287 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Bcas2Q9D287 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bcas2Q9D287 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Bcas2Q9D287 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bcas2Q9D287 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bcas2Q9D287 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bcas2Q9D287 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Bcas2Q9D287 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bcas2Q9D287 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bcas2Q9D287 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bcas2Q9D287 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bcas2Q9D287 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Bcas2Q9D287 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bcas2Q9D287 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Bcas2Q9D287 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bcas2Q9D287 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bcas2Q9D287 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Bcas2Q9D287 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bcas2Q9D287 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bcas2Q9D287 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bcas2Q9D287 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Bcas2Q9D287 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Bcas2Q9D287 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Bcas2Q9D287 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bcas2Q9D287 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Bcas2Q9D287 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bcas2Q9D287 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Bcas2Q9D287 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bcas2Q9D287 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bcas2Q9D287 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Bcas2Q9D287 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bcas2Q9D287 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bcas2Q9D287 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bcas2Q9D287 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bcas2Q9D287 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Bcas2Q9D287 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Bcas2Q9D287 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bcas2Q9D287 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bcas2Q9D287 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Bcas2Q9D287 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Bcas2Q9D287 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bcas2Q9D287 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bcas2Q9D287 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Bcas2Q9D287 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Bcas2Q9D287 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bcas2Q9D287 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Bcas2Q9D287 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Bcas2Q9D287 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bcas2Q9D287 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Bcas2Q9D287 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Bcas2Q9D287 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Bcas2Q9D287 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bcas2Q9D287 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Bcas2Q9D287 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bcas2Q9D287 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bcas2Q9D287 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Bcas2Q9D287 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bcas2Q9D287 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Bcas2Q9D287 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Bcas2Q9D287 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bcas2Q9D287 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bcas2Q9D287 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bcas2Q9D287 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Bcas2Q9D287 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bcas2Q9D287 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bcas2Q9D287 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bcas2Q9D287 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Bcas2Q9D287 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.7 ms