Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc77Q9CZH8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ccdc77Q9CZH8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ccdc77Q9CZH8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc77Q9CZH8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc77Q9CZH8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc77Q9CZH8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ccdc77Q9CZH8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc77Q9CZH8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc77Q9CZH8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccdc77Q9CZH8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccdc77Q9CZH8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc77Q9CZH8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccdc77Q9CZH8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc77Q9CZH8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc77Q9CZH8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc77Q9CZH8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc77Q9CZH8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc77Q9CZH8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc77Q9CZH8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc77Q9CZH8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc77Q9CZH8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc77Q9CZH8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc77Q9CZH8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc77Q9CZH8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc77Q9CZH8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc77Q9CZH8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc77Q9CZH8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc77Q9CZH8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc77Q9CZH8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc77Q9CZH8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc77Q9CZH8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc77Q9CZH8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc77Q9CZH8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc77Q9CZH8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc77Q9CZH8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc77Q9CZH8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc77Q9CZH8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc77Q9CZH8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc77Q9CZH8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc77Q9CZH8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc77Q9CZH8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc77Q9CZH8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc77Q9CZH8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc77Q9CZH8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc77Q9CZH8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc77Q9CZH8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc77Q9CZH8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc77Q9CZH8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc77Q9CZH8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc77Q9CZH8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc77Q9CZH8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc77Q9CZH8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc77Q9CZH8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc77Q9CZH8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc77Q9CZH8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc77Q9CZH8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc77Q9CZH8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc77Q9CZH8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc77Q9CZH8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc77Q9CZH8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc77Q9CZH8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc77Q9CZH8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc77Q9CZH8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc77Q9CZH8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc77Q9CZH8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc77Q9CZH8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc77Q9CZH8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc77Q9CZH8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc77Q9CZH8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc77Q9CZH8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc77Q9CZH8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc77Q9CZH8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc77Q9CZH8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc77Q9CZH8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc77Q9CZH8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc77Q9CZH8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc77Q9CZH8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc77Q9CZH8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc77Q9CZH8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc77Q9CZH8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc77Q9CZH8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc77Q9CZH8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc77Q9CZH8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc77Q9CZH8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc77Q9CZH8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc77Q9CZH8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc77Q9CZH8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc77Q9CZH8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc77Q9CZH8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc77Q9CZH8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc77Q9CZH8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc77Q9CZH8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc77Q9CZH8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc77Q9CZH8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc77Q9CZH8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc77Q9CZH8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc77Q9CZH8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc77Q9CZH8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc77Q9CZH8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms