Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY73

Mrpl44, 39S ribosomal protein L44, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl44Q9CY73 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Mrpl44Q9CY73 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Mrpl44Q9CY73 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Mrpl44Q9CY73 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Mrpl44Q9CY73 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Mrpl44Q9CY73 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Mrpl44Q9CY73 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Mrpl44Q9CY73 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Mrpl44Q9CY73 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Mrpl44Q9CY73 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Mrpl44Q9CY73 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Mrpl44Q9CY73 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Mrpl44Q9CY73 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Mrpl44Q9CY73 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Mrpl44Q9CY73 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Mrpl44Q9CY73 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Mrpl44Q9CY73 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Mrpl44Q9CY73 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Mrpl44Q9CY73 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Mrpl44Q9CY73 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Mrpl44Q9CY73 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Mrpl44Q9CY73 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Mrpl44Q9CY73 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Mrpl44Q9CY73 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Mrpl44Q9CY73 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Mrpl44Q9CY73 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Mrpl44Q9CY73 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Mrpl44Q9CY73 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Mrpl44Q9CY73 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Mrpl44Q9CY73 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Mrpl44Q9CY73 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Mrpl44Q9CY73 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Mrpl44Q9CY73 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Mrpl44Q9CY73 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Mrpl44Q9CY73 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Mrpl44Q9CY73 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Mrpl44Q9CY73 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Mrpl44Q9CY73 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Mrpl44Q9CY73 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Mrpl44Q9CY73 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Mrpl44Q9CY73 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Mrpl44Q9CY73 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Mrpl44Q9CY73 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Mrpl44Q9CY73 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Mrpl44Q9CY73 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Mrpl44Q9CY73 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Mrpl44Q9CY73 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Mrpl44Q9CY73 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Mrpl44Q9CY73 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Mrpl44Q9CY73 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Mrpl44Q9CY73 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Mrpl44Q9CY73 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Mrpl44Q9CY73 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Mrpl44Q9CY73 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Mrpl44Q9CY73 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Mrpl44Q9CY73 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Mrpl44Q9CY73 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Mrpl44Q9CY73 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Mrpl44Q9CY73 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Mrpl44Q9CY73 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Mrpl44Q9CY73 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Mrpl44Q9CY73 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Mrpl44Q9CY73 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Mrpl44Q9CY73 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Mrpl44Q9CY73 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Mrpl44Q9CY73 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Mrpl44Q9CY73 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Mrpl44Q9CY73 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Mrpl44Q9CY73 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Mrpl44Q9CY73 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Mrpl44Q9CY73 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Mrpl44Q9CY73 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Mrpl44Q9CY73 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Mrpl44Q9CY73 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Mrpl44Q9CY73 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Mrpl44Q9CY73 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Mrpl44Q9CY73 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Mrpl44Q9CY73 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Mrpl44Q9CY73 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Mrpl44Q9CY73 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Mrpl44Q9CY73 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Mrpl44Q9CY73 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Mrpl44Q9CY73 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Mrpl44Q9CY73 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Mrpl44Q9CY73 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Mrpl44Q9CY73 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Mrpl44Q9CY73 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Mrpl44Q9CY73 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Mrpl44Q9CY73 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Mrpl44Q9CY73 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Mrpl44Q9CY73 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Mrpl44Q9CY73 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Mrpl44Q9CY73 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Mrpl44Q9CY73 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Mrpl44Q9CY73 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Mrpl44Q9CY73 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Mrpl44Q9CY73 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Mrpl44Q9CY73 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Mrpl44Q9CY73 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Mrpl44Q9CY73 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms