Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT6

Uncharacterized protein C10orf82 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQT6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9CQT6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9CQT6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9CQT6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9CQT6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9CQT6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9CQT6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9CQT6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9CQT6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9CQT6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9CQT6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9CQT6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9CQT6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9CQT6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9CQT6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9CQT6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9CQT6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9CQT6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9CQT6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9CQT6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9CQT6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9CQT6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9CQT6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9CQT6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9CQT6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9CQT6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9CQT6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9CQT6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9CQT6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9CQT6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9CQT6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q9CQT6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9CQT6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9CQT6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9CQT6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9CQT6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9CQT6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9CQT6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9CQT6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9CQT6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9CQT6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9CQT6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9CQT6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9CQT6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9CQT6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9CQT6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9CQT6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9CQT6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9CQT6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9CQT6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9CQT6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9CQT6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q9CQT6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q9CQT6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9CQT6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9CQT6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9CQT6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9CQT6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9CQT6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9CQT6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9CQT6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9CQT6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9CQT6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9CQT6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9CQT6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9CQT6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9CQT6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9CQT6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9CQT6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9CQT6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9CQT6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9CQT6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9CQT6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9CQT6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9CQT6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9CQT6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9CQT6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9CQT6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9CQT6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9CQT6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9CQT6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9CQT6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9CQT6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9CQT6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9CQT6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9CQT6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Q9CQT6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9CQT6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9CQT6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9CQT6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9CQT6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9CQT6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Q9CQT6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q9CQT6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Q9CQT6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Q9CQT6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9CQT6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9CQT6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9CQT6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9CQT6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms