Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ8

Cmc1, COX assembly mitochondrial protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmc1Q9CPZ8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cmc1Q9CPZ8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cmc1Q9CPZ8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cmc1Q9CPZ8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cmc1Q9CPZ8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cmc1Q9CPZ8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cmc1Q9CPZ8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cmc1Q9CPZ8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cmc1Q9CPZ8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cmc1Q9CPZ8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cmc1Q9CPZ8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cmc1Q9CPZ8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cmc1Q9CPZ8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cmc1Q9CPZ8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cmc1Q9CPZ8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cmc1Q9CPZ8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cmc1Q9CPZ8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cmc1Q9CPZ8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cmc1Q9CPZ8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cmc1Q9CPZ8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cmc1Q9CPZ8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Cmc1Q9CPZ8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Cmc1Q9CPZ8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cmc1Q9CPZ8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cmc1Q9CPZ8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cmc1Q9CPZ8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cmc1Q9CPZ8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cmc1Q9CPZ8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cmc1Q9CPZ8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cmc1Q9CPZ8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cmc1Q9CPZ8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cmc1Q9CPZ8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cmc1Q9CPZ8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cmc1Q9CPZ8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cmc1Q9CPZ8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cmc1Q9CPZ8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cmc1Q9CPZ8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cmc1Q9CPZ8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cmc1Q9CPZ8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cmc1Q9CPZ8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Cmc1Q9CPZ8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cmc1Q9CPZ8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cmc1Q9CPZ8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cmc1Q9CPZ8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cmc1Q9CPZ8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cmc1Q9CPZ8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cmc1Q9CPZ8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cmc1Q9CPZ8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cmc1Q9CPZ8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cmc1Q9CPZ8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Cmc1Q9CPZ8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cmc1Q9CPZ8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cmc1Q9CPZ8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cmc1Q9CPZ8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cmc1Q9CPZ8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cmc1Q9CPZ8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cmc1Q9CPZ8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cmc1Q9CPZ8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cmc1Q9CPZ8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cmc1Q9CPZ8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cmc1Q9CPZ8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cmc1Q9CPZ8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cmc1Q9CPZ8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cmc1Q9CPZ8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cmc1Q9CPZ8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cmc1Q9CPZ8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cmc1Q9CPZ8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cmc1Q9CPZ8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cmc1Q9CPZ8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cmc1Q9CPZ8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cmc1Q9CPZ8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cmc1Q9CPZ8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cmc1Q9CPZ8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cmc1Q9CPZ8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cmc1Q9CPZ8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cmc1Q9CPZ8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cmc1Q9CPZ8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cmc1Q9CPZ8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cmc1Q9CPZ8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cmc1Q9CPZ8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cmc1Q9CPZ8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cmc1Q9CPZ8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cmc1Q9CPZ8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cmc1Q9CPZ8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cmc1Q9CPZ8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cmc1Q9CPZ8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cmc1Q9CPZ8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cmc1Q9CPZ8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cmc1Q9CPZ8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cmc1Q9CPZ8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cmc1Q9CPZ8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cmc1Q9CPZ8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cmc1Q9CPZ8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cmc1Q9CPZ8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cmc1Q9CPZ8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cmc1Q9CPZ8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cmc1Q9CPZ8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cmc1Q9CPZ8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cmc1Q9CPZ8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cmc1Q9CPZ8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms