Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB3

Tcam1, Cell adhesion molecule TCAM-1, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcam1Q99NB3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tcam1Q99NB3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tcam1Q99NB3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tcam1Q99NB3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tcam1Q99NB3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tcam1Q99NB3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tcam1Q99NB3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tcam1Q99NB3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tcam1Q99NB3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tcam1Q99NB3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tcam1Q99NB3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tcam1Q99NB3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tcam1Q99NB3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tcam1Q99NB3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tcam1Q99NB3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tcam1Q99NB3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tcam1Q99NB3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tcam1Q99NB3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tcam1Q99NB3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tcam1Q99NB3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tcam1Q99NB3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tcam1Q99NB3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tcam1Q99NB3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tcam1Q99NB3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tcam1Q99NB3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tcam1Q99NB3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tcam1Q99NB3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Tcam1Q99NB3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tcam1Q99NB3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tcam1Q99NB3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tcam1Q99NB3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tcam1Q99NB3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tcam1Q99NB3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tcam1Q99NB3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tcam1Q99NB3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tcam1Q99NB3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Tcam1Q99NB3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tcam1Q99NB3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tcam1Q99NB3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Tcam1Q99NB3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tcam1Q99NB3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tcam1Q99NB3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tcam1Q99NB3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tcam1Q99NB3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tcam1Q99NB3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tcam1Q99NB3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tcam1Q99NB3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tcam1Q99NB3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tcam1Q99NB3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tcam1Q99NB3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tcam1Q99NB3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Tcam1Q99NB3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tcam1Q99NB3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Tcam1Q99NB3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Tcam1Q99NB3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tcam1Q99NB3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tcam1Q99NB3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tcam1Q99NB3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tcam1Q99NB3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tcam1Q99NB3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tcam1Q99NB3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tcam1Q99NB3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tcam1Q99NB3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tcam1Q99NB3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tcam1Q99NB3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tcam1Q99NB3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tcam1Q99NB3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tcam1Q99NB3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tcam1Q99NB3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Tcam1Q99NB3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tcam1Q99NB3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tcam1Q99NB3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tcam1Q99NB3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tcam1Q99NB3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tcam1Q99NB3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tcam1Q99NB3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tcam1Q99NB3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tcam1Q99NB3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tcam1Q99NB3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tcam1Q99NB3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tcam1Q99NB3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tcam1Q99NB3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tcam1Q99NB3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tcam1Q99NB3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tcam1Q99NB3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tcam1Q99NB3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tcam1Q99NB3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tcam1Q99NB3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tcam1Q99NB3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Tcam1Q99NB3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Tcam1Q99NB3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tcam1Q99NB3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tcam1Q99NB3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tcam1Q99NB3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tcam1Q99NB3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Tcam1Q99NB3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tcam1Q99NB3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tcam1Q99NB3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tcam1Q99NB3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tcam1Q99NB3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms