Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dok4Q99KE3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dok4Q99KE3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dok4Q99KE3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Dok4Q99KE3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dok4Q99KE3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Dok4Q99KE3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dok4Q99KE3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dok4Q99KE3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dok4Q99KE3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dok4Q99KE3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dok4Q99KE3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Dok4Q99KE3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dok4Q99KE3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Dok4Q99KE3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dok4Q99KE3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dok4Q99KE3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dok4Q99KE3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Dok4Q99KE3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dok4Q99KE3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Dok4Q99KE3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Dok4Q99KE3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dok4Q99KE3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dok4Q99KE3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dok4Q99KE3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Dok4Q99KE3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dok4Q99KE3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Dok4Q99KE3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Dok4Q99KE3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Dok4Q99KE3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dok4Q99KE3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dok4Q99KE3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Dok4Q99KE3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dok4Q99KE3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dok4Q99KE3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dok4Q99KE3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dok4Q99KE3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Dok4Q99KE3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dok4Q99KE3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Dok4Q99KE3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dok4Q99KE3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dok4Q99KE3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dok4Q99KE3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dok4Q99KE3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dok4Q99KE3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dok4Q99KE3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Dok4Q99KE3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dok4Q99KE3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dok4Q99KE3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dok4Q99KE3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dok4Q99KE3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dok4Q99KE3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dok4Q99KE3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dok4Q99KE3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dok4Q99KE3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dok4Q99KE3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dok4Q99KE3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dok4Q99KE3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dok4Q99KE3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dok4Q99KE3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dok4Q99KE3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Dok4Q99KE3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dok4Q99KE3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dok4Q99KE3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dok4Q99KE3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dok4Q99KE3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dok4Q99KE3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Dok4Q99KE3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dok4Q99KE3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dok4Q99KE3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dok4Q99KE3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Dok4Q99KE3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dok4Q99KE3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dok4Q99KE3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dok4Q99KE3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dok4Q99KE3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dok4Q99KE3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dok4Q99KE3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dok4Q99KE3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Dok4Q99KE3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dok4Q99KE3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Dok4Q99KE3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Dok4Q99KE3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Dok4Q99KE3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Dok4Q99KE3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dok4Q99KE3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dok4Q99KE3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dok4Q99KE3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dok4Q99KE3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dok4Q99KE3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dok4Q99KE3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dok4Q99KE3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dok4Q99KE3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dok4Q99KE3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dok4Q99KE3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dok4Q99KE3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Dok4Q99KE3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dok4Q99KE3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dok4Q99KE3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dok4Q99KE3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms